国家粮食局科学研究院是在1957年成立的粮食部科学研究院和粮食部设计院的基础上发展起来的，至今建院已50多年。目前，国家粮食局科学研究院是粮食行业唯一一家国家级社会公益型科研机构。

    一九五七年一月经国家建委批准粮食部分别成立粮食部科学研究所和粮食部设计院。
    一九六〇年十一月粮食部设计院、粮食部科学研究所合并为粮食部科学研究设计院。
    一九七二年在商业部设计院内设粮油设计室。
    一九七九年商业部、粮食部分开，在商业部设计院粮油设计室基础上筹备并于一九八〇年三月恢复粮食部科学研究设计院。
    一九八二年八月，商业部、粮食部、全国供销合作总社三部合并后新的商业部决定，并经国家科委一九八四年十二月批准，以原粮食部科学研究设计院为主组建商业部科学研究院，同时以商业部粮食设计院名义对外。
    一九九四年一月国务院机构改革撤销商业部、物资部，组建国内贸易部。经中央机构编制委员会办公室同意，商业部科学研究院（商业部粮食设计院）更名为国内贸易部科学研究院（国内贸易部北京设计院）。
    一九九八年国务院机构改革，撤销国内贸易部，成立了国家贸易局，科学技术部和国家经贸委[国科发政字（1999）197号]文将我院划转国家粮食储备局（国家粮食储备局于1991年4月组建）所属。
    一九九九年六月经中央机构编制委员会办公室同意，国内贸易部科学研究院（国内贸易部北京设计院）更名为国家粮食储备局科学研究院（国家粮食储备局设计院）。
    二〇〇一年四月经中央机构编制委员会办公室同意，国家粮食储备局科学研究院更名为国家粮食局科学研究院。
 
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